Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms