Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms