Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms