Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Urb1Q571H0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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