Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf608Q56A10 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Znf608Q56A10 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms