Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn34b4Q3V0X2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms