Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms