Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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