Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms