Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Shcbp1lQ3TTP0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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