Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms