Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ptcd3Q14C51 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms