Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms