Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vps8Q0P5W1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps8Q0P5W1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms