Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc21bQ0HA38 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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