Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms