Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Thbs3Q05895 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms