Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp1P97350 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms