Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mesp1P97309 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mesp1P97309 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mesp1P97309 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mesp1P97309 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mesp1P97309 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms