Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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