Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ppp1cbP62141 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms