Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CgnP59242 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CgnP59242 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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