Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp5bP56480 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atp5bP56480 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms