Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lbx1P52955 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lbx1P52955 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Lbx1P52955 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Lbx1P52955 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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