Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Fgd1P52734 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms