Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
TspoP50637 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
TspoP50637 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms