Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SftpdP50404 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SftpdP50404 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms