Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtshP49935 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtshP49935 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms