Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmod1P49813 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms