Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb42P49222 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb42P49222 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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