Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
GdnfP48540 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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