Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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VdrP48281 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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VdrP48281 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VdrP48281 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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