Protein–RNA interactions for Protein: P47750

Tshr, Thyrotropin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TshrP47750 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TshrP47750 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TshrP47750 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TshrP47750 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TshrP47750 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TshrP47750 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TshrP47750 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TshrP47750 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TshrP47750 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms