Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ItgavP43406 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms