Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms