Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxc5P32043 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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