Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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