Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtprmP28828 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PtprmP28828 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtprmP28828 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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