Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa2P28309 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms