Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pde6aP27664 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde6aP27664 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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