Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ggta1P23336 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ggta1P23336 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms