Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Fcer1aP20489 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Fcer1aP20489 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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