Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pou5f1P20263 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou5f1P20263 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms