Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VimP20152 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VimP20152 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VimP20152 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VimP20152 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VimP20152 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VimP20152 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VimP20152 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms