Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms