Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms