Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd1d1P11609 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms