Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm18200-201ENSMUST00000173265 833 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm18190-201ENSMUST00000174801 832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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