Protein–RNA interactions for Protein: P0CG50

Ubc, Polyubiquitin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbcP0CG50 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbcP0CG50 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbcP0CG50 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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