Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04213 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P04213 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P04213 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P04213 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms